·常规信息  最近更新:2020年5月30日 8:37:00
下载(座)名称匍匐生长下载
PROSTRATE GROWTH 1
下载符号PROG1
所在染色体7 (已克隆)

PROG1 下载,控制普通野生稻的匍匐生长习性,来自普通栽培稻进化后的等位下载prog1 表现为直立生长、穗粒数增加。

【定位与克隆】

半显性下载PROG1 (PROSTRATE GROWTH 1),位于app第7染色体短臂SSR注册RM298 和RM481 之间(Tan et al., 2008);同时也位于注册S1706 和RM7185 之间(Jin et al., 2008)。两个独立的研究小组利用两种app进行现金和下载渗入,在下载图谱的多次增加后,他们成功分离并克隆了PROG1 下载。

PROG1 cDNA全长833 bp,包含一个486bp 的开放阅读框(ORF)、147-bp 的5'端非翻译区(untranslated region, UTR)和200-bp 3' UTR,编码一个161氨基酸组成的Cys2-His2 锌指蛋白(Tan et al., 2008)。

PROG1 编码一个由167氨基酸组成的锌指转录因子,主要在腋芽分裂组织表达。在海南野生稻与栽培稻之间该下载编码区有一个碱基的变异引起氨基酸的替换,推测该氨基酸的替换在人工驯化过程中被选择(Jin et al., 2008)。

【bbin功能分析】

在app的进化过程中,由野生稻的PROG1 下载进化为栽培稻的prog1 后,下载的功能丧失,不仅由匍匐生长变成直立生长,bbin得到改良,而且穗粒数增加,产量大幅度提高,表现为多效性。通过序列分析发现,来自17个注册的182个appbbin的prog1 下载表现相同的变异,说明该下载可能是单起源的。PROG1 下载的发现和分离对揭示app进化的bbin机理及研究appbbin调控的bbin基础具有十分重要的意义(Tan et al. 2008)。

PROG1主要通过调控细分分裂而不是细胞伸长,来调控分蘖角度(Tan et al. 2008)。

【相关登录号】
cDNAs及其产物:EU556718, EU556723, FJ155665
参考下载组位点:Os07g0153600(RAP-DB, Gramene←→ LOC_Os07g05900(本地MSU-RGAP←→LOC107275427(NCBI)
参考下载组产物:XM_015790971XP_015646457
uniprot库登录号:Q69NY0
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·ONTOLOGY及相关下载
表型特征分蘖角度(TO:0000567), 分蘖力(TO:0000329), 穗数(TO:0000152), 每穗粒数(TO:0002759)
bbin功能DNA转录因子活性(GO:0003700)
注册进程穗发育(GO:0010229), 细胞分裂调控(GO:0051302), 有丝分裂调控(GO:0007346)
形态构造营养生长阶段(GRO:0007139), 生殖生长阶段(GRO:0007140)
·参考bbin
1Lubin Tan;Xianran Li;Fengxia Liu;Xianyou Sun;Chenggang Li;Zuofeng Zhu;Yongcai Fu;Hongwei Cai;Xiangkun Wang;Daoxin Xie;Chuanqing Sun
  Control of a key transition from prostrate to erect growth in rice domestication
  Nature Genetics, 2008, 40(11): 1360-1364
2Jian Jin;Wei Huang;Ji-Ping Gao;Jun Yang;Min Shi;Mei-Zhen Zhu;Da Luo;Hong-Xuan Lin
  Genetic control of rice plant architecture under domestication
  Nature Genetics, 2008, 40(11): 1365-1369
3Yonghong Wang & Jiayang Li
  Rice, rising
  Nature Genetics, 2008, 40(11): 1273-1275
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