| ·常规信息 最近更新：2020年11月6日 13:36:00 | |||||||||||||
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| 下载(座)名称 | 籽粒大小 regulator of grain size | ||||||||||||
| 下载符号 | GS5 | ||||||||||||
| 所在染色体 | 5 （已克隆） | ||||||||||||
GS5(JN256055/JN256056, Li et al. 2016)... GS5编码一个丝氨酸羧肽酶，正向调控app籽粒大小。 【突变体表型】GS5高表达具有更大的籽粒（Li et al. 2011; Xu et al. 2015）。 【定位与克隆】GS5位于第5染色体短臂的RM593和RM574之间。 【时空表达谱】GS5等位下载具有节律性，在白天转录逐步增加。GS5在绿色组织中的表达量通常高于非绿色组织如茎秆、根、幼穗以及胚乳；非绿色组织中，GS5最高的表达量主要在长度为1-11cm的幼穗中；开花阶段，外稃/内稃中GS5表达量显著上调（Xu et al. 2015）。 【亚细胞定位】
【bbin功能】GS5编码一个丝氨酸羧肽酶，是一个控制app粒宽、充实度和千下载的数量性状下载（Li et al. 2011）。 GS5启动子区域的两个关键单核苷酸多态性(SNPs)造成app幼穗中GS5的差异表达，这决定了籽粒大小的差异。GS5表达增强会通过占据OsBAK1-7的胞外富亮氨酸重复(LRR)结构域，竞争性地抑制OsBAK1-7和OsMSBP1间的互作，进而阻止OsBAK1-7与OsMSBP1互作而产生的胞吞作用（Xu et al. 2015）。 【相关登录号】
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| ·ONTOLOGY及相关下载 | |
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| 表型特征 | 籽粒大小(TO:0000397), 种子发育特征(TO:0000653), 籽粒产量(TO:0000396), 粒宽(TO:0000402), 千下载(TO:0000592) |
| bbin功能 | 丝氨酸羧肽酶活性(GO:0004185) |
| 注册进程 | 细胞分裂的正向调节(GO:0051781), 种子发育(GO:0048316), 胞吞作用调节(GO:0030100) |
| ·参考bbin |
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| 1. Chunjue Xu;Yu Liu;Yibo Li;Xiaodong Xu;Caiguo Xu;Xianghua Li;Jinghua Xiao;Qifa Zhang Differential expression of GS5 regulates grain size in rice Journal of Experimental Botany, 2015, 66(9): 2611-2623 |
| 2. Yibo Li;Chuchuan Fan;Yongzhong Xing;Yunhe Jiang;Lijun Luo;Liang Sun;Di Shao;Chunjue Xu;Xianghua Li;Jinghua Xiao;Yuqing He;Qifa Zhang Natural variation in GS5 plays an important role in regulating grain size and yield in rice Nature Genetics, 2011, 43(12): 1266-1269 |
| 3. Xing Y Z;Tan Y F;Hua J P;Sun X L;Xu C G Characterization of the main effects, epistatic effects and their environmental interactions of QTLs on the genetic basis of yield traits in rice Theoretical and Applied Genetics, 2002, 105(2-3): 248-257 |
| 4. Li J X;Yu S B;Xu C G;Tan Y F;Gao Y J;Li X H;Zhang Q F Analyzing quantitative trait loci for yield using a vegetatively replicated F2 population from a cross between the parents of an elite rice hybrid Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101(1-2): 248-254 |
| 5. Y. F. Tan;Y. Z. Xing;J. X. Li;S. B. Yu;C. G. Xu;Qifa Zhang Genetic bases of appearance quality of rice grains in Shanyou 63, an elite rice hybrid Theoretical and Applied Genetics, 2000, 101(5-6): 823-829 |
| 6. Yu S B;Li J X;Xu C G;Tan Y F;Gao Y J;Li X H;Zhang Q F;Saghai Maroof M A Importance of epistasis as the genetic basis of heterosis in an elite rice hybrid Proceedings of the National Academy of Sciences, 1997, 94(17): 9226-9231 |
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